產(chǎn)品概述:
本試劑盒采用改進(jìn)的SDS 堿裂解法,結(jié)合DNA制備膜選擇性地吸附DNA的方法達(dá)到快速純化質(zhì)粒DNA的目的。適合于從120-300 ml 細(xì)菌培養(yǎng)物中提取多至500 μg高純的質(zhì)粒DNA,用于測(cè)序、體外轉(zhuǎn)錄與翻譯、限制性內(nèi)切酶消化、細(xì)菌轉(zhuǎn)化等分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。
一、試劑盒組成、貯存、穩(wěn)定性
Cat.No. |
UE-MX-P-5 |
UE-MX-P-10 |
UE-MX-P-25 |
Kit size |
5 preps |
10 preps |
25 preps |
Maxiprep column |
5 |
10 |
25 |
RNase A |
135 μl |
270 μl |
700 μl |
Buffer S1 |
70 ml |
115 ml |
285 ml |
Buffer S2 |
70 ml |
115 ml |
285 ml |
Buffer S3K |
70 ml |
115 ml |
285 ml |
Buffer B |
70 ml |
115 ml |
285 ml |
Buffer W1 |
80 ml |
160 ml |
350 ml |
Buffer W2 concentrate |
36 ml |
2×36 ml |
150 ml |
Eluent |
13 ml |
25 ml |
60 ml |
Protocol manual |
1 |
1 |
1 |
RNase A :50 mg/ml, 室溫貯存6個(gè)月;長期貯存于-20℃。
Buffer S1:細(xì)菌懸浮液,加入RNase A后,混合均勻,4℃貯存。
Buffer S2:細(xì)菌裂解液(含SDS/NaOH),室溫密閉貯存。
Buffer S3K:中和液,室溫密閉貯存。
Buffer B:DNA結(jié)合溶液,室溫密閉貯存。
Buffer W1:洗滌液,室溫密閉貯存。
Buffer W2 concentrate:去鹽液。使用前,按試劑瓶上指定的體積加入無水乙醇(用100%乙醇或95%乙醇),混合均勻,室溫密閉貯存。
Eluent:2.5 mM Tris-HCI,pH 8.5,室溫密閉貯存。
常見問題解答:
◆同樣體積的新鮮菌液,為什么有些提取的質(zhì)粒濃度高,而有些質(zhì)粒的濃度低?這些情況應(yīng)該如何處理?
質(zhì)粒提取高低的一個(gè)重要決定性因素是質(zhì)粒載體的拷貝數(shù),即質(zhì)粒在一個(gè)大腸桿菌中的數(shù)目。對(duì)于低拷貝數(shù)的質(zhì)粒,需要適當(dāng)增加菌液的收集量,詳情請(qǐng)參閱說明書。
以下是幾種常見載體的拷貝數(shù):
粒提取1.png.png)
◆使用UE質(zhì)粒大量制備試劑盒時(shí),在DNA結(jié)合/洗滌步驟中能否使用離心法?
可以,使用與離心機(jī)配套的離心管可以進(jìn)行離心。
◆我提取的質(zhì)粒為什么會(huì)有基因組條帶?
菌體在裂解和中和過程中如果操作過于劇烈就容易引起基因組污染。加入Buffer S2后要輕柔混勻,加入Buffer S3后混合均勻。如果發(fā)現(xiàn)裂解物在操作過程中過于黏稠,需要適當(dāng)降低菌體的用量。
◆我提取的質(zhì)粒在電泳圖片上看,有一條緊挨著主帶的小條帶請(qǐng)問這是什么原因?如何判定它是否是雜帶?
那條帶很有可能就是變性條帶。如果在加入Buffer S2后沒有及時(shí)混勻菌體,會(huì)導(dǎo)致菌體局部堿性過強(qiáng),破壞質(zhì)粒的結(jié)構(gòu),在加入Buffer S3后質(zhì)粒無法完全復(fù)性,就產(chǎn)生了這樣的變性條帶。
檢測(cè)的方式是通過酶切檢測(cè),如果這條帶在酶切后依然存在,則是變性條帶,如果酶切后消失,則可能是質(zhì)粒的不同狀態(tài)。
◆我提取的質(zhì)粒有明顯的RNA污染,請(qǐng)問是什么原因?
可能有以下兩種可能:
1、RNase A活力下降。Buffer S1在加入RNase A后要保存在4℃冰箱。如果室溫放置,RNase A活力會(huì)下降,導(dǎo)致RNA污染。
2、菌體過量。如果使用的菌體量過多,也可能導(dǎo)致RNA污染。適當(dāng)減少菌體的用量。
◆質(zhì)粒得率很低,請(qǐng)問是什么原因?
質(zhì)粒低的可能因素很多,以下是幾種可能原因:
1、菌體過量,導(dǎo)致菌體不能完全裂解和中和,最終導(dǎo)致質(zhì)粒得率低。
2、Buffer W2中未按瓶子上得標(biāo)注體積加入乙醇。
3、菌體老化,影響提取的效果。建議對(duì)菌液進(jìn)行劃板培養(yǎng),篩選新鮮克隆。◆請(qǐng)問Eluent Buffer的配方是什么?對(duì)于DNA測(cè)序有沒有影響?
Eluent Buffer 的配方是2.5mM Tris-HCl,pH8.0。質(zhì)粒在這樣的溶液中能夠穩(wěn)定保存,而且測(cè)序不受影響。